Diplômé de la Manhattan School of Music, Stefon Harris se destine à une carrière en musique classique jusqu'à ce qu'il découvre le jazz de Charlie Parker. Après avoir collaboré avec Steve Turre, Charlie Hunter et d'autres, le vibraphoniste et compositeur fait ses débuts comme leader avec A Cloud of Red Dust, en 1998. Oeuvre en 11 mouvements, The Grand Unification Theory voit le jour en 2001. Trois ans plus tard, l'artiste endisque Evolution avec un groupe qu'il baptise Blackout. Suivent notamment Urbanus (2009) et Ninety Miles (2011). En marge des tournées et des enregistrements, à son compte avec diverses formations comme le SF Jazz Collective, Stefon Harris se dévoue également à l'enseignement.