Geri Allen fait ses gammes à la Cass Technical High School de Detroit, sa ville d'origine. Après avoir poursuivi ses études jusqu'à la maîtrise, la compositrice et pianiste lance sa carrière professionnelle à New York. Au milieu des années 1980, elle collabore avec le collectif M-Base puis enregistre un premier disque à titre de leader, The Printmakers (1984). Parallèlement, Allen multiplie les collaborations. Elle forme notamment un trio avec Charlie Haden et Paul Motian et met son talent d'improvisatrice au service d'Ornette Coleman, avec qui elle enregistre Sound Museum (1996). Pour The Life of a Song (2004), elle s'entoure de Dave Holland et Jack DeJohnette. Le disque piano solo Flying Toward the Sound voit le jour en 2010. Deux ans plus tard, elle collabore au disque Secret of the Wind, d'Elisabeth Kontomanou.